Gökhan Gönül Gençlerbirliği

Gönül 2002 yılında ise 3 yıllık sözleşme imzaladı. İlk sezonunda PAF takıma yollanan Gönül bu takımla 19 maça çıktı.

2003-04 sezonunda Gençlerbirliği ASAŞ'a kiralandı. 3. Lig'de yer alan bu takımda ise 27 maça çıkıp 5 gol attı ve takımı ile sezonu şampiyon bitirdi ve bir üst lige katıldı.

2004-05 sezonunda Hacettepe takımına transfer oldu. Lig B Klasman'da 21 maça çıkıp 4 gol attı.

2005-06 sezonu öncesinde Gençlerbirliği'nde dönen Gönül, Ziya Doğan döneminde takımın ilk maçı Fenerbahçe maçıdır. Hoca "Bende isim değil çalışan oynar, şu anda kadroda sadece Gökhan'ın yeri garanti" demişti. Ama bir sakatlık yaşadı ve 3-4 ay oynayamadı. Kendine gelmesi için OFTAŞ'a gönderildi. Takım Lig A'ya çıkınca "Kadroyu bozmayalım. Hiç olmazsa küme düşmeyelim. Devre arasına kadar kal. Nasıl olsa maddi açıdan Gençlerbirliği futbolcularıyla aynı imkâna sahipsin" denildi. Ama devreyi lider bitirince hedef büyüdü ve şampiyonluk hedefine giden takımda kalmayı tercih etti. Nitekim de şampiyon oldu ve Lig B'de o sezon 17 maça çıkan Gönül, 3 gol attı ve takımı ile şampiyonluk yaşadı ve Lig A'ya yükseldi. O dönem Giray Kaçar ve İlhan Eker ile takımın vazgeçilmezi oldu.

2006-07 sezonu başındaysa Oftaş ile üst üste şampiyonluklar yaşayan Gönül, Süper Lig'de oynayan Gençlerbirliği kadrosuna dahil edildi. 2006 yılında Gençlerbirliği OFTAŞ'ta oynarken Galatasaray, Gönül'ü 19 yaşında iken istemiş, fakat İlhan Cavcav'ın Gökhan için 2,5 milyon Euro gibi, Galatasaray tarafından çok fazla bulunan bir miktar istemesi transferi gerçekleştirmemiştir ve Gökhan bir sene daha Gençlerbirliği Oftaş'ta forma giymiştir. Takımıyla 28 lig maçına çıkan Gönül, 4 gol atarken 2 de kupa maçına çıktı.