Şener Özbayraklı Bugsaşspor

Keçiörengücü'ndeki performansıyla dikkat çeken Şener, 2010-11 sezonu öncesinde ise Ankara'nın bir diğer ekibi Bugsaşspor'a transfer oldu.Bu takımla ilk maçına 29 Ağustos günü Adıyamanspor karşısında çıktı. Bu maçı takımı 1-0 kazanırken, Şener 90 dakika sahada kaldı. Sezon boyuncu takımıyla 30 maça çıkan Şener, sezon sonunda ise Spor Toto 2. Lig Play Off'una katılma hakkı kazandı. "90" numaralı formasıyla Önder Özen'in değişilmezi olan Şener, play-off'lar'da da takımında forma giydi. İlk olarak takımının Eyüpspor ile oynadığı 1. maçta takımının 5-0 yendiği kadroda 90 dakika yer aldı. Bu maçta kaleci Bekir Sevgi ile takımın en çok dikkat çeken ismi olan Şener, takımıyla yarı finalde Sakaryaspor ile eşleşti. O dönem kadrosunda Berat Çetinkaya ve Salih Dursun gibi yetenekli futbolcular bulunduran takıma karşı ilk 11'de başlayan Şener, normal süresi 1-1 biten karşılaşmada forma giydi ve maç penaltılara gitti. 119. dakikada oyundan alınan Şener'in takımı rakibine penaltılarda 6-5 boyun eğdi ve aynı ligde yoluna fevam etti.

Bu takımla ilk maçına 11 Eylül 2011'de Gaziosmanpaşa karşısında çıktı. 21 Aralık 2011'de ise kariyerindeki ilk Türkiye Kupası maçına TKİ Tavşanlı Linyitspor karşısında çıktı. Takımı bu maçı 2-0 kazandı. Baki Mercimek gibi tecrübeli bir ismi savunmasında bulunduran Bugsaşspor'da bir sonraki kupa turunda ise Manisaspor ile karşılaştı ve 90 dakika forma giydiği maçı takımı 2-1 kazandı ve Süper Lig ekibinin kadrosunda Isaac Promise ve Ahmet İlhan Özek gibi önemli hücum silahlarını ise durduran isim Şener oldu. Ahmet Yavuz tarafından 20 Mart 2012 tarihinde Bursaspor ile oynanan kupa maçında da oynatıldı. Bu maçta Bekir Sevgi ile birlikte Bursaspor teknik direktörü Ertuğrul Sağlam'ın dikkatini çekti. Maç boyunca Gökçek Vederson ve Stanislav Sestak'a geçit vermeyen ve bitmek tükenmek bilmeyen enerjisiyle maçın normal süresinin 0-0 bitmesini sağlayan Şener, 93.dakikada Sebastian Pinto ve 118. dakikada Turgay Bahadır'ın gollerine engel olamadı ve takımı 2-0 mağlup olarak elendi. O sezon ligde 31 maça çıkan oyuncu, Türkiye Kupası'nda ise 3 maça çıktı ve 4 sarı, 1 kırmızı kart gördü.

2012-13 sezonunda ise sezon başında Süper Lig'den başta Bursaspor olmak üzere başka bir sürü lig ve 1. Lig ekibinin Şener'i istemesi nedeniyle takımdan ayrılmak istediğini belirttiği için kadro dışı kaldı. Daha sonra ise yönetimle konuştu ve tekrar kadroya alındı. O sezon ilk maçına ise 14 Ekim günü Ünyespor ile oynanan maçın 71. dakikasında çıktı Ahmet Yavuz yönetimindeki takımda sezonun ilk yarısında 9 maça çıkan Şener, 14 Kasım 2012 tarihinde ise bu takım kariyerindeki ilk golünü İstanbul Güngörenspor ağlarına attı. 2 Aralık 2012'de de Hatayspor maçında forma giyen Şener, maçın 82. dakikasında takımına 1-1 beraberliği getiren golü attı. Türkiye Kupası'nda da 1 maçta forma giydi.