Kulüp takımları kariyeri
Eski bir futbolcu olan Branko Smiljanić'in oğlu olan Milan, futbola Partizan'da başladı. 2005-2006 sezonunda aynı takımda profesyonel olan Smiljanić, ilk sezonundan sonra, 2007'de Espanyol'a transfer oldu. Katalan ekibinde ilk sezonunda 35 maç resmi maça çıkan Smiljanić, ertesi sezon da 27 maça çıktı. Smiljanić, kısa bir süre Sporting Gijón'a kiralık verildikten sonra tekrar eski kulübü Partizan'a kiralandı. Bir sezon sonra da bonservisiyle birlikte Belgrad'a döndü. Partizan formasıyla ligin yanı sıra Avrupa ve Şampiyonlar Ligi'nde de mücadele eden Smiljanić, kulübüyle 3 şampiyonluk yaşadı.
29 Mayıs 2013'te Gençlerbirliği'ne bedelsiz transfer olan Smiljanić ile 3 yıllık sözleşmeye imza attı. 2013-2014 sezonunda Süper Lig'de sadece 1 kez forma şansı bulan Smiljanić'in sözleşmesi, 30 Aralık 2014'te kulüple karşılıklı olarak feshedildi.