Kulüp kariyeri
Anthony 2008 yılında Kristianstad BoIS takımında oynadı. Kristianstad takımı tarafından sözleşmesi uzatılamadı.
Anthony Nwakaeme kariyerine 2010 yılında Universitatea Cluj'dan kiralık olarak İkinci Lig'deki Rumen kulübü Arieșul Turda'da başladı. Sekiz maç oynadı ve beş gol attı.
Ocak 2011'de Universitatea Cluj'a geri döndü ve 2011-12 sezonunda 28 maçta forma giydi ve 7 gol kaydetti.
2012-13 sezonunun ilk yarısını Petrolul Ploiești'de geçirdi ve yalnızca üç maçta forma giydi.
Return to Universitatea Cluj
Şubat 2013'te Universitatea Cluj'a geri döndü ve on maçta forma giyip iki gol attı.
13 Ağustos 2013'te Nwakaeme, Hapoel Ra'anana ile sözleşme imzaladı. 31 Ağustos'ta, İsrail Premier Ligi'ndeki ilk maçında, Hapoel Haifa ile 1-1 berabere kalınan maçta bir gol attı.
24 Haziran 2015'te Nwakaeme, Hapoel Be'er Sheva ile anlaştı. 3 Ekim 2015'te Be'er Sheva için ilk golünü attı. Bu gol aynı zamanda Turner Stadyumu'ndaki ilk gol oldu.
Nwakaeme, 2017 yılında İsrail Premier Ligi'nde en iyi oyuncu ödülünü kazandı.
Nijeryalı orta saha oyuncusu John Ogu ve İsrailli forvetler Ben Sahar ve Elyaniv Barda ile birlikte Hapoel Be'er Sheva'yı 2016, 2017 ve 2018'de üst üste üç İsrail şampiyonluğuna taşıdı.
20 Ağustos 2018'de 1 milyon 10 bin € karşılığında Süper Lig takımı Trabzonspor ile sözleşme imzaladı. Trabzonspor ile ilk resmi maçına 25 Ağustos 2018 tarihinde oynanan Ankaragücü maçında 74. dakika da oyuna dahil olarak çıktı. 1 Eylül 2018 tarihinde Akyazı Stadyumu'nda oynanan ve Trabzonspor'un Galatasaray'ı 4-0 yendiği maçta 2 gol ve 1 asist yaparak parladı. 2021-22 Süper Lig sezonunda Trabzonspor ile Süper Lig şampiyonluğu yaşadı. Trabzonspor'da 'Bay beyin' lakabını aldı. Trabzonsporlu taraftarlar tarafından heykeli yapıldı.
2022 yılında El-Feyha takımına bedelsiz transfer oldu, toplam 45 maça çıkan Anthony toplamda 13 gol kaydetti.
Trabzonspor'a geri dönüşü ve vedası
2024 yılında Anthony tekrar Trabzonspor'a bedelsiz şekilde transfer oldu. 22 Mayıs 2026 tarihinde Konyaspor ile oynanan Türkiye Kupası final maçından sonra kazanılan kupa ile Trabzonspor'a veda etti. 24 Mayıs tarihinde Trabzonspor Youtube kanalından ''Veda'' isimli bir video yayınlandı, videoda Nwakaeme şu sözleri söyledi: "Farklı duygular içindeyim. Ama hepsini toparlayacak olursam iyi hissediyorum, minnettarım. Kupa kazandığım her maç, birlikte mücadele ettiğim her oyuncu, her teknik direktör ve özellikle Trabzon’daki tüm taraftarlar için minnettarım.
Onlar bunu hak ediyor, hatta bundan daha fazlasını hak ediyorlar. İnanılmaz destek oldular. Geri dönüp baktığımızda sadece kupalar değil, insanların bana yaklaşımı da çok değerliydi. Bunu yanımda görebildiğim için gurur duyuyorum.
Size mesajım şu: Teşekkür ederim, teşekkür ederim, teşekkür ederim. Size kaç kere teşekkür etsem az. Size fazla söyleyeceğim bir şey yok. Sadece her şey için ne kadar minnettar olduğumu söylemek istiyorum.
Şunu bilin ki Trabzonspor oyuncusu olmasam da ben büyük bir Trabzonspor taraftarıyım. Her şey için size