Muhammed Dahlan İkinci İntifada

2001 yılında Dahlan, Filistin Ulusal Otoritesinde reform çağrısında bulunmaya başladı ve tutarlı bir politika eksikliğinden duyduğu memnuniyetsizliğini dile getirerek Yasser Arafat'ı rahatsız etti.

2002 yılında, İçişleri Bakanı olma umuduyla Gazze'de Önleyici Güvenlik başkanı olduğu görevinden istifa etti; ama dışişleri bakanı olamadı ve kendisine güvenlik danışmanı olması için bir görev teklif edildi ancak bu teklifi reddetti. Nisan 2003'te Arafat'ın itirazına rağmen Mahmud Abbas tarafından Filistin Güvenlik Bakanı olarak atandı. Eylül ayında, Abbas Başbakan olarak istifa ettiğinde görevden alındı ve yerine Hakam Balawi geçti .

Defalarca reform ve yolsuzlukla mücadele için kampanya yürütmeye çalıştı ve birçok gözlemci onun kişisel bütünlüğüne itiraz etmesine rağmen kendisini Arafat'ın açık sözlü eleştirmeni olarak göstermeye çalıştı. Yine de Dahlan ve iç Fetih seçimlerindeki taraftarları, Gazze'deki Fetih bölgelerinin çoğunu kazandı.

2004 yılında Dahlan'ın, Arafat'ın yeğeni Musa Arafat'ın Gazze polis kuvvetleri başkanı olarak atanmasını dolayısıyla çıkan ve bir hafta süren Gazze'deki karışıklığın arkasında bulunduğu varsayıldı. Bu atama, İsrail'in Gazze şeridinden geri çekilmesinden önce, Dahlan'ın konumunu zayıflatmak için kasıtlı bir adım olarak kabul edildi ve büyük protestolara yol açtı.