İsmail Köybaşı Beşiktaş JK

İsmail 26 Haziran 2009 tarihinde Rıdvan Şimşek ile beraber Beşiktaş'a transfer oldu. İlk sezonunda 16 maçta forma giydi, bunların 13'ü ilk 11'de oldu. Beşiktaş'ın Ankaragücü'ni 1-0 yendiği maçta maçı kazandıran golü attı. İlk sezonunda 16 lig maçında 1 gol 2 asist ile oynadı.

İkinci sezonunda 19 lig maçında 1 gol atıp 3 asist yapmaya başardı.

Beşiktaş'taki 3.sezonunda takım kaptanı İbrahim Üzülmez'ın takımdan ayrılmasıyla sürekli oynamaya başladı ve bu sezonda 31 maçta 4 asist yaptı. Aynı yıl İspanya'nın ünlü spor gazetesi MARCA tarafından 2011 yılının gelecek vadeden 11 futbolcu arasın da gösterilmiştir. İspanya'nın önde gelen gazetesi Marca, 2011 yılına damga vurma ihtimali olan ve izlenmesi gereken 11 genç yıldızı belirlerken, Beşiktaş'ın Millî futbolcusu İsmail Köybaşı da bu değerli listede kendine yer buldu. Marca gazetesinin hazırladığı ve birçoğu 20 yaşın altında olan 11 yıldız adayı futbolcu şöyle:

Marca Gazetesi Geleceğin 11'i: Alex Oxlade-Chamberlain(Watford), Marc Bartra(Barcelona), İsmail Köybaşı(Beşiktaş),Jack Wilshere(Arsenal), Mario Götze(Borussia Dortmund), Yannis Tafer(Lyon), Philippe Coutinho(Inter), Romelu Lukaku(Anderlecht), Emmanuel Mayuka(Young Boys), Alvaro Morata(Real Madrid), Neymar(Santos)

2011-2012 sezon sonunda Türkiye millî takımı ile Bulgaristan arasında 29 Mayıs 2012 tarihinde oynana hazırlık maçının 41. dakikasında bir sakatlık yaşayan İsmail Köybaşı yerini Hasan Ali Kaldırım'a bırakarak oyundan çıktı. Yapılan kontrollerde İsmail'in çapraz bağlarının koptuğu ve 6 ay sahalardan uzak kalacağı açıklandı.Uzun bir süre sonra sahalara kısa bir süre döndü, yine aynı yerden sakatlanarak bu yeni durum sonrası sahalardan 6 ay uzak kalacağı ve sezonu kapattığı öğrenildi.

Beşiktaş JK'nın Türkiye Kupası Dördüncü turu 05.12.2013 tarihindeki Bucaspor maçıyla yeşil sahalara geri döndü.Sakatlıklarla boğuşan İsmail Köybaşı, Süper Lig'de 7, Türkiye kupasında 1, olmak üzere toplam 8 maça çıktı.

Yeni sezonda, teknik direktör Slaven Bilic oldu.Süper Lig de 12, Türkiye Kupasında 6, Şampiyonlar Ligi Elemelerinde 4, UEFA Avrupa Liginde 3, toplamda 25 maça çıkıp.1 Asist yaptı.Şampiyonlar ligi eleme 2.tur ilk maçında, sol ayaklı olmasına rağmen, sağ bekte çok iyi performans sergiledi.40 yıllık sağ bek gibi yorumları yapıldı.19.02.2015 tarihindedki UEFA Avrupa Ligi C Grubu son maçı olan Totenham maçında sakatlandı. Menisküs yırtığı teşhisi konuldu.Ameliyat oldu ve sezonu kapattı.

2015-2016 Sezonunda Beşiktaş Teknik Direktörü, Slaven Bilic West Ham United'a transfer oldu.Beşiktaş yeni Teknik Direktörü Şenol Güneş oldu. İyi bir sezon başı hazırlık kampı geçirdi.Süper Lig'in ilk 5 haftası Ramon Motta ve Dusko Tosic sol bekte görev yaptı. İstediği verimi alamayan Şenol Güneş, İsmail Köybaşı'nı sol beke monte etti. Sezon sonunda Beşiktaş, sözleşmesi biten ve yeni teklif yapılmayan İsmail Köybaşı ile yollarını ayırdı.