Heliopolis Muharebesi Muharebe öncesi

1798'den beri Fransız işgalindeki Mısır üzerine yürüyen Sadrazam Yusuf Ziya Paşa komutasındaki Osmanlı ordusu 17 Aralık 1799'da kuşattığı El-Ariş'i 21 Aralık'ta teslim aldıktan sonra ileri harekâtını sürdürdü. İngiliz donanmasının mevcudiyeti nedeniyle Mısır'da mahsur kalan Fransız ordusunun komutanı General Jean-Baptiste Kléber ile Sadrazam Yusuf Ziya Paşa'nın temsilcileri arasında yürütülen müzakereler sonucunda 24 Ocak 1800 tarihinde taraflar arasında Mısır'ın tahliyesini öngörüne bir şartname imzalandı. Bu şartname uyarınca, Osmanlı ordusu ağırlıklarını ve ağır toplarını geride bırakarak Kahire'ye yürüdü. Fransız ordusu ise tahliye amaçlı olarak kuvvetlerini Dimyat, Raşid ve İskenderiye'ye yola çıkarmaya hazırlandı. Osmanlı İmparatorluğu şartname uyarınca Fransız askerlerini taşımak için İskenderiye'ye 45 gemi gönderdi.

Bu esnada, General Kléber'in Fransa Direktuvarına gönderdiği 8 Ekim 1799 tarihli mektup İngilizlerin eline geçti. Mektupta kayıtlı ifadelerden Fransız ordusunun çok kötü durumda olmasını anlayan İngilizler Fransızların Şartname uyarınca ağırlıklarıyla birlikte tahliyesi fikrinden vazgeçerek, Fransızlara daha zorlu koşullar içeren bir şartname hazırlanması fikriyle ateşkesi bozdular. Buna mukabil, Köse Mustafa Paşa komutasındaki Osmanlı öncü birlikleri 12 Mart 1800'de Kahire'yi teslim almaya hazırlanıyordu. General Kléber Sadrazam Yusuf Ziya Paşa'ya elçi göndererek İngilizlerin Şartnameyi tanıması için girişimde bulunmasını istedi. Yusuf Ziya Paşa ise teminat vererek Kahire'nin derhal teslim ve tahliyesini talep etti. Bu gelişmeler üzerine, tahliye koşullarının tehlikeye girdiğini düşünen General Kléber Köse Mustafa Paşa'yı hapsettirerek, Osmanlılara baskın şeklinde hücum etmeye karar verdi.