Kulüp kariyeri
Stoper ve sol bek mevkiinde görev yapan futbolcu, üç kez üst üste Galatasaray altyapısında şampiyonluk yaşayıp, Galatasaray A takımına yükseldi. 1.85 cm boyunda ve sol ayaklı olup, eski Galatasaraylı futbolcu Sefer Karaer'in oğludur. Sefer Karaer 1981-1986 yıllarında Galatasaray'da futbol oynamıştır.
Galatasaray'ın Manisaspor'dan Hakan Balta'yı transfer etmesinden dolayı Anıl Karaer, sözleşme gereği Aydın Yılmaz'la beraber 2007-2008 sezonunda kiralık olarak bir seneliğine Vestel Manisaspor'a verildi.
Burada uyum sorunu yaşamasında dolayı yarim sezon sonra Galatasaray'a geri döndü ve sezonun ikinci yarısında Çaykur Rizespor'a kiralık verildi. 2008-2009 sezonunda MKE Ankaragücü takımına kiralandı burada sözleşmesini birkaç hafta ardından feshettirdi ve sezonun kalan bölümünü Galatasaray'ın ara takımı olan Beylerbeyi'nde geçirdi.
2009-2010 sezonunda bonservisi ile Adanaspor'a transfer oldu. Adanaspor'da uyum sorununu yaşamadan ilk 11'de düzenli olarak oynamaya başladı ve ilerleyen zamanla takımın en önemli oyuncuları arasına girdi. İlk sezonunda 1. Lig'in en iyi onbirine seçilerek ve ödüllendirildi.