Futbolculuk kariyeri
1980'de, Orduspor altyapısında futbolculuk kariyerine başlayan Bayraktar, 1981-82 sezonunda A takıma yükseldi. 1983-84 sezonunda, Orduspor ile Türkiye 1. Futbol Ligi'nde ilk kez forma giydi. 1986-87 sezonu başında Rizespor'a, 1988-89 sezonu başında Konyaspor'a transfer oldu. 1990-91 sezonunu geçirdiği Trabzonspor'da hiçbir lig maçına çıkmayan Bayraktar; sezon sonu Konyaspor'a, 1992-93 sezonu başında ise Orduspor'a döndü. 1995-96 sezonunda Ünyespor'da kiralık oynaması dışında 1998'e kadar burada kaldı. 1998-99 sezonunu Fatsa Belediyespor'da geçirdikten sonra futbolculuk kariyerini sonlandırdı.
Teknik direktörlük kariyeri
Futbolculuk kariyerini sonlandırdıktan sonra teknik direktörlük yapmaya başlayan Bayraktar; 1999-2000 yıllarında Fatsa Belediyespor'un, 2000-2001 yıllarında ise Ünyespor'un teknik direktörlüğünü yaptıktan sonra 2001-2003 arasında Orduspor, 2004'te ise Bulancakspor'da antrenörlük yaptı. 2004'te Bulancakspor ve sonrasında Adıyamanspor, 2005'te ikinci kez Adıyamanspor, 2005-2006 yıllarında Giresunspor, 2006-2007 yıllarında ikinci kez Bulancakspor, 2007-2008 yıllarında Gümüşhanespor, 2008-2009 yıllarında Gebzespor, 2009-2010 yıllarında Batman Petrolspor, 2010-2011 yıllarında üçüncü kez Adıyamanspor, 2011'de ikinci kez Gümüşhanespor, 2012-2013 yıllarında ikinci kez Fatsa Belediyespor, 2013-2014 yıllarında 68 Yeni Aksarayspor, 2014-2015 yıllarında Bayrampaşa, 2015'te Orduspor, 2016'da ikinci kez Bayrampaşaspor, 2016-2017 yıllarında Pazarspor, 2017-2018 yıllarında Siirt İl Özel İdaresispor, 2018'de Adıyaman 1954, 2019-2020 yıllarında Artvin Hopaspor, 2020-2021 yılları arasında 52 Orduspor teknik direktörü olarak görev yaptı. 2021'den itibaren Arnavutköy Belediyespor'un teknik direktörlüğünü üstlenmektedir. 2021-2022 Sezonu öncesi Kahta 02 Spor Kulübü teknik direktörlüğüne getirilmiştir. Buradan ayrıldıktan sonra devre arasında tekrar Pazarspor ile anlaşmıştır.